Er bestaan vijf soorten prairiehonden: de zwartstaartprairiehond (Cynomys ludovicianus), de Mexicaanse prairiehond (Cynomys mexicanus), de Gunnisonprairiehond (Cynomys gunnisoni), de witstaartprairiehond (Cynomys leucurus) en de Utahprairiehond (Cynomys pardivens).